Los Programas de Posgrado del CUCBA, se inscriben en un modelo de evaluación y actualización permanente, funcionan con eficiencia, basados en los planes de desarrollo elaborados en forma colegiada por los miembros de los cuerpos académicos, operan de manera coordinada y complementaria con las líneas de investigación de la institución, son de calidad y cuentan con reconocimiento nacional e internacional por su excelencia académica.
Los Coordinadores de los programas de posgrado son:
- Dra. Laura Guzmán Dávalos
- Doctorado en Biosistemática, Ecología y Manejo de Recursos Naturales y Agrícolas (BEMARENA)
- Dr. Francisco Martín Huerta Martínez
- Doctorado en Ecofisiología y Recursos Genéticos DERGE
- Dr. Félix Héctor Martínez Sánchez
- Doctorado en Ciencia del comportamiento (Orientación Neurociencia)
- Dr. Gerardo Alfonso Ortíz Rueda
- Maestría en Ciencia del Comportamiento (Analisis de la Conducta)
- Dra. Patricia Zarazua Villaseñor
- Maestría en Ciencias en Biosistemática, y Manejo de Recursos Naturales y Agrícolas (BIMARENA)
- Mtra. Elba A. Castro Rosales
- Maestría en Educación Ambiental a Distancia
- Dr. Francisco Javier Padilla Ramírez
- Maestría Interinstitucional en Producción Pecuaria
- Dra.Silvia Lizette Ramos de Robles
- Maestría en Ciencias de la Salud Ambiental
- Dra. Adriana Natividad Avendaño López
- Maestría Profesionalizante en Tecnología de Semillas (MAPTESE)